在所有菩提子中，莲花菩提无疑是最为珍贵和稀少的一种菩提子，莲花菩提子也是菩提类佛珠中价格最高的品类之一，同时又极具有传世与收藏价值。
莲花菩提子是一种叫川谷的草本植物的种子，这种植物主要分部在印度以及西亚和中亚等地区，在我国和日本也有少量出现。莲花菩提子它形似莲花,因而得名，莲花菩提子呈浅褐色，经过长时间把玩后色泽比较红润，颜色呈暗红。莲花菩提形状似莲花，质地坚硬,摸起来稍有刺手感，莲花的中心还有一只美丽的眼睛，被藏家誉为佛眼。莲花菩提子周围有齿状，直径一般在1.5厘米左右。收藏人士在判断莲花菩提的品相时，讲究的是“齿满、桩矮”，也就是好品相的莲花菩提子要求是齿饱满并且齐全，没有缺齿的，同时莲花桩要矮，不能太高，好品相的“桩矮”莲花菩提状似磨盘。
莲花在佛教中是纯洁清静的象征,也是佛教中的圣物，因而莲花菩提颇得佛教信众们的青睐，认为莲花菩提象征西方莲华部阿弥陀佛，即属於西方莲华部，代表至高无上的尊荣、清新、和平、福慧双全、一切圆满之意。因此密宗中修炼莲花部时须用莲花菩提念珠，对成就菩萨位较有帮助。
莲花菩提子佛珠最常见的是108颗的款式，因为百八莲、百八眼，正是一串108颗莲花菩提佛珠的写照，因此很多高僧如果能获得一串莲花菩提佛珠，都会作为压箱底的珍品。现在即使在印度莲花菩提也非常稀有，市场上齿全的好品相莲花菩提更是很少，完整的莲花菩提子佛珠十分难求。一条108颗的一般品相的莲花菩提念珠市场上的价格不会低于1000元。
